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在Red Hat 5(AS 5)上配置多节点MPI互联

第一步,以普通用户账户登录系统


到MPI的官方网站上下载mpich2-1.1.tar.gz


官网地址乃google所得


下载完毕后,将该压缩包放在根目录底下


$ tar -xzvf mpich2-1.1.tar.gz


将该压缩包直接解压到根目录底下


第二步,$ su #登录root账户


$ cd /mpich2-1.1


$ ./configure –prefix=/usr/local/mpich2-1.1


# –prefix= 后面乃mpich2-1.1的安装路径


$ make


$ make install


$ exit #退出root账户


第三步,$ cd /home/you # you 乃普通用户账户名


$ vim .bash_profile


在该文件的最后追加如下两行


export PATH=/usr/local/mpich2-1.1/bin:$PATH


export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/mpich2-1.1:$LD_LIBRARY_PATH


之后保存退出


$ source .bash_profile


$ touch .mpd.conf


$ echo “secretword=…” > .mpd.conf


# … 乃用户随意设置的密码,最好不同于普通用户账户的密码


$ chmod 600 .mpd.conf


第四步,测试MPI环境是否已经搭建成功


$ mpd & #启动后台守护进程


$ mpdtrace -l #显示守护进程的主机名和端口号


$ mpdallexit #杀死守护进程


如果第四步顺利执行,就表明普通用户账户的MPI环境已经成功搭建起来了。之后要是将开始时解压缩得到的文件夹删除也没有关系。

在Red Hat 5(AS 5)上配置多节点MPI互联:


在各节点上分别执行:


第一步,以root账户登录系统


安装mpich2-1.1,具体步骤参见这里


第二步,$ vim /etc/sysconfig/network


# 将文件中的“localhost.localdomain”修改为


# “{自定义主机名}.localdomain”


# 然后保存退出


第三步,$ vim /etc/hosts


# 将文件中的“127.0.0.1”(即本机回路地址)修改为


# “{本机当前IP地址} {自定义主机名}.localdomain {自定义主机名} ”


# 注意,此处的“自定义主机名”必须与第二步修改的相同


# 然后保存退出


$ reboot # 重启系统,使修改生效


第四步,以root账户登录系统


$ service iptables stop


# 关闭本机的防火墙


第五步,在主控节点上


$ mpd & # 启动后台守护进程


$ mpdtrace -l # 查看并记录端口号


在其他各节点上


$ mpd -h {主控节点当前IP地址} -p {刚才记录的主控节点端口号} &


# 启动后台守护进程,并使该进程与主控节点的守护进程相联


第六步,$ mpdtrace -l # 显示当前相联的各节点的 主机名_端口号(IP地址)


如果第五步顺利执行的话,各节点就通过MPI成功互联了。


PS:过程中参考了mpich2-1.1的userguide。


精确控制各节点进程数的指令为:


$ mpiexec -l -n {进程数1} -host {节点1的IP地址} {程序1} : -n {进程数2} -host {节点2的IP地址} {程序2} : ……


从该指令可以看出,MPI允许各节点运行不同的程序。

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