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Ubuntu下安装doris及相关软件教程

安装doris这类的开源专业软件,在linux下面还算简单,但第一条是认真阅读doris主页上的说明,大部分软件包都有一些先置条件。在debian和Ubuntu由于apt的管理,先置软件包的安装非常方便。
下面一步步讲解如何在ubuntu下安装doris及相关软件,安装环境是ubutu11.04 amd64 。

0)安装之前gcc,g++,make这些软件应该都安装好了,不确定的话就运行下面一条命令。

代码:
$ sudo apt-get install gcc g++ make
1)下载doris和fftw包,都放在自己的主目录下面,比较好操作。


我下载的是doris_v4.02.tar.gz和fftw-3.3.tar.gz。


软件fftw-3.3.tar.gz和fftw-3.3.tar.gz下载。


免费下载地址在 http://linux.linuxidc.com/


用户名与密码都是www.linuxidc.com


具体下载目录在 /pub/2011/06/21/Ubuntu下安装doris及相关软件教程/


2)先解压doris,然后在doris目录里面解压fftw,让fftw目录在doris目录里面。由于doris4.02需要fftw-3.2.1,还需要把fftw改一下名字。以下是操作命令。


代码:
$tar xzfv doris_v4.02.tar.gz
//自动生成了doris_v4.02目录,文件在doris_v4.02目录里面
$cd doris_v4.02
$ cp ../fftw-3.3.tar.gz .
//把下载在上一层目录里面的fftw-3.3.tar.gz文件拷贝到当前目录下面
$tar xzfv fftw-3.3.tar.gz
//解压
$ mv fftw-3.3/ fftw-3.2.1/
//目录改名

3)编译、安装fftw库及doris


代码:
$ cd fftw-3.2.1/

$ ./configure –prefix=`pwd` –enable-float


注意,–prefix=`pwd`中的斜撇是键盘上数字1边上的斜撇。


这一步configure选项可以进一步优化。我们现在的机器都支持sse,cpu都是多核心的,可以加上–enable-sse 和 –with-combined-threads选项,也就是下面的命令


$./configure –prefix=`pwd` –enable-float –enable-sse –with-combined-threads


//特别的,如果是32位linux系统,用的是amd的cpu,可以加上 –enable-k7


 

$ make
$ make install
//编译安装,注意–prefix=`pwd`选项保证了fftw库直接安装在pwd,也就是当前的 fftw-3.2.1目录,doris编译时会直接找到自己目录下的fftw。
下面编译安装doris。作者要求我们在tcsh环境下编译doris,我试过直接在bash下面编译也没有问题,这里还是按照作者要求在tcsh里面完成。所以,安装doris前安装一个tcsh。

代码:
$sudo apt-get install tcsh
$cd ..
//回到doris目录

$tcsh


$ cd src


//进入到doris下面的src目录


$ ./configure


//回答应该是一路回车,g++,fftw的lib,include等三个问题是关键,都可以自动完成,如果有异常,请检查前面。其他的回车就可以。

$ make
$ sudo make install

//最后一步安装doris到/usr/local/bin需要root权限


$ exit


//安装完成后退出 tcsh


这样就安装好了doris。

4)下面是一些应用,SARtools和ENVISAT_TOOLS 。源代码都在doris目录里面

SARtools很简单的三步

代码:

$cd doris_v4.02/SARtools

$make
$sudo  make install

我用的是64位ubuntu,ENVISAT_TOOLS 需要先安装 libc-dev-i386

代码:
$sudo apt-get install  libc6-dev-i386
然后make和sudo make install

代码:

$ cd doris_v4.02/ENVISAT_TOOLS


$ make

$sudo make install

5)下面是getorb,snaphu,GMT

doris主页download页面(http://doris.tudelft.nl/Doris_download.html)有getorb和snaphu的相关链接


snaphu与getorb软件下载getorb_2.3.2.tar.gz和snaphu-v1.4.2.tar.gz。


免费下载地址在 http://linux.linuxidc.com/


用户名与密码都是www.linuxidc.com


具体下载目录在 /pub/2011/06/21/Ubuntu下安装doris及相关软件教程/


解压下载的软件,进入解压后的目录,命令就不重复给了,直接给出安装要点。

getorb需要使用fortran进行编译,先安装一个fortran包

代码:
$ sudo apt-get install gfortran
$ vi Makefile
//修改Makefile 找到 FC = gfortran 行,删除前面的#号(vi操作:光标移到#,按x,esc,冒号,wq保存退出。)
然后make 和 sudo make install

snaphu在安装man文件的时候会出现小问题。解决办法,安装之前先建一个目录:

代码:
$ sudo mkdir /usr/local/man/man1然后很简单,进入src目录,make 和 sudo make install。

GMT包可以直接用apt-get安装,

代码:
$ sudo apt-get install gmt

6)以上软件的执行文件都安装在 /usr/local/bin下面,到该目录里面去检查一下,发现有几个文件没有执行权限,增加执行权限即可。


代码:
$  cd  /usr/local/bin
$ sudo chmod 755 *.*
$ sudo chmod 755 *

7)tsx影像的读取问题,需要安装gdal,python,libxml2,python-lxml,libxslt1等软件包,直接用apt-get命令解决。


代码:
$ sudo apt-get install gdal-bin libxslt1.1 python-lxml python libxml2

8)安装 matlab2010a
下载matlab2010a for linux,原始文件名为[矩阵实验室\].Mathworks.Matlab.R2010a.UNIX.ISO-TBE.iso matlab.iso
先把iso文件改个名字:

代码:
$ mv  \[矩阵实验室\].Mathworks.Matlab.R2010a.UNIX.ISO-TBE.iso matlab.iso
挂载iso

代码:
$ sudo mount -t iso9660 -o ro,loop=/dev/loop0 相关路径/matlab.iso /mnt
安装matlab之前解决libc.so.6找不到的问题

代码:
$ sudo ln -s /lib64/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 /lib/libc.so.6
再进入相关目录,运行安装程序

代码:
$ cd /mnt
$  ./install

安装好之后还有一个建立执行链接的问题:


1)如果安装在/usr之类的目录下,桌面上右键,创建启动器,命令中填入 gksudo ‘Matlab安装目录/bin/matlab -desktop’ 即可;


2)如果安装在自己的登录目录,桌面上右键,创建启动器,命令中填入  Matlab安装目录/bin/matlab -desktop’ 即可;


另外还有中文字体的问题,直接在matlab里面file—perferences—fonts设置中文字体即可。


9)stamps的安装,下载StaMPS_v3.2.1.tar.gz 。

代码:

$tar xfzv StaMPS_v3.2.1.tar.gz


进入StaMPS_v3.2.1


$ cd StaMPS_v3.2.1

$ make
$ sudo make install
这样就全部完成了。

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