重新安装的Ubuntu 16.04, 需要安装Molcas(包含其中的DMRG【QCmauqis】模块时)额外需要的软件包/库如下
1) 库
apt-get install gfortran
apt-get install cmake
apt-get install python-dev
apt-get install python-numpy
apt-get install python-scipy
apt-get install python-matplotlib
apt-get install libhdf5-*
2) GSL
需要下载编译,不过倒是很简单 按步骤一步一步来即可
http://www.gnu.org/software/gsl/
依赖的库全都配置好后,就可以编译了
编译之前,可以使用 ccmake ../ 再来调整一下配置
编译的时候,个人使用以下的参数
export MKLROOT=/opt/intel/mkl/
CC=gcc FC=gfortran cmake -DLINALG=MKL -DOPENMP=ON -DDMRG=ON ../
编译的过程中ALPS的程序库,QCmaquis都是自动下载的。所以编译过程中可能会稍微卡住一下,因为后台在下载两者的代码。
如果需要单独的DMRG程序的时候,需要与QCmaquis的开发组联系,很简单 发个邮件就可以的
http://www.reiher.ethz.ch/software/maquis.html
链接速度在国内也是还是很快的 (我是在NJU用的,跟在ETH的时候没有太大差别)
.bashrc配置可以参考以下
#Molcas and QCMaquis
source /home/yingjin/Chem_soft/Molcas_local_nongfu/V1/qcmaquis/bin/qcmaquis.sh
export PATH=/home/yingjin/Chem_soft/Molcas_local_nongfu/V1/alps/bin:/home/yingjin/Chem_soft/Molcas_local_nongfu/V1/qcmaquis/bin:$PATH
export PYTHONPATH=/home/yingjin/Chem_soft/Molcas_local_nongfu/V1/alps/lib:/home/yingjin/Chem_soft/Molcas_local_nongfu/V1/qcmaquis/lib/python/pyeval:/home/yingjin/Chem_soft/Molcas_local_nongfu/V1/qcmaquis/lib/python:$PYTHONPATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/yingjin/Chem_soft/Molcas_local_nongfu/V1/alps/lib:$LD_LIBRARY_PATH
#Molcas
export PATH=/home/yingjin/Chem_soft/Molcas_local_nongfu/V1/sbin:$PATH
(记录一下 省着忘了还得看文档…)
* 安装完之后,如果采用cmake的话,可能会有以下问题
1)可能提示找不到molcas执行脚本
直接cp sbin/molcas.driver 到 molcas 然后 chmod +x molcas 就可以了
2)可能提示找不到molcas安装路径
~/.Molcas/molcas 里面写上安装地址即可 其实molcas脚本里面看看就知道怎么回事了
3)可能提示warning.plx丢失
我的话,重新新建了个 放到安装目录的data里面就可以的 具体的原因还得问问其他人
# this is auto generated file. Do not edit!
$_RC_GROUP_AND_= 240;
$_RC_GROUP_INTERNAL_= 64;
$_RC_GROUP_WARNING_= 80;
$_RC_GROUP_ERROR_= 96;
$_RC_GROUP_USER_ERROR_= 112;
$_RC_GROUP_CRITICAL_= 128;
$_RC_ALL_IS_WELL_= 0;
$_RC_JOB_KILLED_= 1;
$_RC_CONTINUE_LOOP_= 64;
$_RC_INVOKED_OTHER_MODULE_= 65;
$_RC_CONTINUE_UNIX_LOOP_= 66;
$_RC_CHO_DUM_= 67;
$_RC_EXIT_= 68;
$_RC_EXIT_EXPECTED_= 69;
$_RC_DO_TASKS_= 70;
$_RC_GENERAL_WARNING_= 80;
$_RC_NOT_CONVERGED_= 96;
$_RC_TIMEOUT_= 100;
$_RC_INPUT_ERROR_= 112;
$_RC_INPUT_EMIL_ERROR_= 113;
$_RC_LICENSE_= 114;
$_RC_CHO_INP_= 115;
$_RC_CHECK_ERROR_= 116;
$_RC_INSTALL_ERROR_= 117;
$_RC_INTERNAL_ERROR_= 128;
$_RC_EXTERNAL_TERMINATION_=129;
$_RC_GENERAL_ERROR_= 130;
$_RC_FLOATING_EXCEPTION_= 134;
$_RC_EXTERNAL_TERM_= 137;
$_RC_MEMORY_ERROR_= 139;
$_RC_IO_ERROR_WRITE_= 161;
$_RC_IO_ERROR_READ_= 162;
$_RC_CHO_MEM_= 163;
$_RC_CHO_INI_= 164;
$_RC_CHO_LOG_= 165;
$_RC_CHO_RUN_= 166;
更多Ubuntu相关信息见Ubuntu 专题页面 http://www.linuxidc.com/topicnews.aspx?tid=2
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